MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methylobacterium radiotolerans JCM 2831 plasmid pMRAD08

Total Repeats: 85

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010507	CAC	2	6	17	22	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_010507	GAGTG	2	10	44	53	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010507	TCG	2	6	115	120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010507	AT	3	6	130	135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010507	CGT	2	6	161	166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010507	A	6	6	234	239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010507	GCC	2	6	381	386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_010507	T	7	7	397	403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010507	GCCC	2	8	468	475	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10	NC_010507	CGG	2	6	493	498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010507	GCC	2	6	4452	4457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_010507	CGGA	2	8	4465	4472	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_010507	CCGG	2	8	7627	7634	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_010507	GAT	2	6	8884	8889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010507	GGC	2	6	8922	8927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_010507	CGCC	2	8	8937	8944	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
17	NC_010507	CCTT	2	8	8948	8955	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_010507	GC	3	6	9008	9013	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_010507	CCGG	2	8	9111	9118	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_010507	G	6	6	11301	11306	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010507	AGTTC	2	10	11364	11373	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_010507	GC	4	8	11383	11390	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_010507	CAT	2	6	11396	11401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010507	ATTGG	2	10	11404	11413	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010507	GCG	2	6	11448	11453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010507	CCCAA	2	10	11471	11480	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
27	NC_010507	CTG	2	6	11520	11525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010507	CTT	2	6	11540	11545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_010507	AGC	2	6	11709	11714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010507	CGG	2	6	11723	11728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010507	CAG	2	6	11729	11734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010507	AGA	2	6	11779	11784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010507	ATA	2	6	11789	11794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010507	CCG	2	6	11870	11875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_010507	CAA	2	6	11903	11908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010507	TCT	2	6	11927	11932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010507	TCG	2	6	11965	11970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_010507	CT	3	6	12001	12006	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_010507	CGG	2	6	12060	12065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010507	CGG	3	9	12069	12077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010507	AGC	2	6	12110	12115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010507	AGC	2	6	13433	13438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010507	CAG	2	6	15734	15739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010507	CGG	2	6	15788	15793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010507	GAGC	2	8	15828	15835	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_010507	GGC	2	6	15862	15867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010507	AGA	2	6	16168	16173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010507	CTG	2	6	16242	16247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_010507	TCG	2	6	16460	16465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010507	CGG	2	6	16472	16477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_010507	GGC	2	6	16752	16757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_010507	GCG	2	6	17818	17823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010507	TG	3	6	17905	17910	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010507	GCA	2	6	18439	18444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010507	GCT	2	6	18457	18462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010507	GC	4	8	18524	18531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_010507	AGC	2	6	18582	18587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010507	CG	5	10	19054	19063	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_010507	TGA	2	6	19211	19216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010507	GCT	2	6	19226	19231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010507	CGT	2	6	19245	19250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_010507	GAG	2	6	19281	19286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010507	TGCGG	2	10	19297	19306	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
64	NC_010507	CG	4	8	19345	19352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_010507	GC	3	6	19356	19361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_010507	GC	3	6	19369	19374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_010507	CG	4	8	19378	19385	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_010507	GACG	2	8	19477	19484	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_010507	CCA	2	6	19491	19496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_010507	GCC	2	6	19504	19509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_010507	ACC	2	6	19554	19559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_010507	CCT	2	6	19657	19662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_010507	CTGG	2	8	19671	19678	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_010507	TCC	2	6	19686	19691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_010507	GAT	2	6	19728	19733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010507	TGA	2	6	19746	19751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010507	TCA	2	6	19823	19828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_010507	CTT	2	6	20256	20261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010507	ACA	2	6	20283	20288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_010507	GC	3	6	20289	20294	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_010507	CGT	2	6	20333	20338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_010507	CCCT	2	8	20682	20689	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
83	NC_010507	GCC	2	6	20742	20747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_010507	CCA	2	6	20755	20760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_010507	TA	3	6	20764	20769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.